上海世博會事務協調局（以下簡稱“上海世博局”）是世博會的組織者，于2003年10月30日成立。在組委會、執委會領導下，上海世博局具體負責世博會的籌備、組織、運作和管理，并協助世博會政府總代表開展工作。上海世博局的主要職責是：承擔上海世博會執委會在決策、協調中的日常工作；負責上海世博會籌備工作的日常組織管理、協調與上海世博會有關的對外合作與交流活動及世博會的運營工作。
世博局設置的部門及其主要職責如下：
1、辦公室
2、綜合計劃部
（1）資產管理中心
3、國際參展部
4、參展者服務中心
（1）訂房中心
5、技術辦公室
6、工程部（工程建設指揮部辦公室）
7、總建筑師辦公室
8、總工程師辦公室
9、禮賓部
10、接待部
11、園區商業管理服務部
12、市場開發部
13、物流中心
14、參觀者服務中心
15、票務中心
16、安保部
（1）證件管理中心
17、交通管理部
18、信息化部
（1）信息中心
19、園區志愿者部
20、新聞宣傳部
（1）世博網站
（2）世博雜志
21、論壇事務部
22、活動部
23、主題演繹部／研究中心
24、規劃部
25、資金財務部
26、人力資源部
27、培訓中心
28、法律事務部
29、行政中心
30、黨群工作部
31、監察審計部
32、中國館部
33、主題館部
34、非洲聯合館管理部
35、AB片區部
36、C片區部
37、DE片區部
38、城市最佳實踐區部
39、綠地公園片區域
